top of page
​業績

研究報告

  • Mabreja, A.D., V.P. Reyes, Than Kutay Soe, K. Shimakawa, D. Makihara, S. Nishiuchi, and K. Doi (2024) Evaluation of grain-filling-related traits using Taichung 65 x DV85 chromosome segment substitution lines (TD-CSSLs) of rice. Plants 13: 289.

  • Kikuta, M., D.M. Menge, E.W. Gichuhi, H. Samejima, R. Tomita, J.M. Kimani, R.N. Musila, K. Doi, M. Ashikari, R. Angeles-Shim, K.K. Jena and Daigo Makihara (2023) Contribution of genes related to grain number (Gn1a and WFP) introgressed into NERICA 1 to grain yield under tropical highland conditions in central Kenya. Plant Prod. Sci. 26: 309-319.

  • Tomita, R., V.P. Reyes, Y. Fukuta, E.W. Gichuhi, M. Kikuta, D.M. Menge, K. Doi and D. Makihara (2023) Genetic variation of blast (Pyricularia oryzae Cavara) resistance in the Longistaminata chromosome segment introgression lines (LCSILs) and potential for breeding use in Kenya. Plants 12: 863.

  • V.P. Reyes, J.K. Kitony, S. Nishiuchi, D. Makihara, K. Doi (2022) Utilization of genotyping-by-sequencing (GBS) for rice pre-breeding and improvement: A review. Life 12: 1752.(review)

  • Goto, I., S. Neang, R. Kuroki, V.P. Reyes, K. Doi, N.S. Skoulding, M. Taniguchi, A. Yamauchi and S. Mitsuya (2022) QTL analysis for sodium removal ability in rice leaf sheaths under salinity using an IR-44595/318 F2 population. Front. Plant Sci. 13: 1002605.

  • Bascon, M.V., T. Nakata, S. Shibata, I. Takata, N. Kobayashi, Y. Kato, S. Inoue, K. Doi, J. Murase and S. Nishiuchi (2022) Estimating yield-related traits using UAV-derived multispectral images to improve rice grain yield prediction. Agriculture 12: 1141.

  • Than Kutay Soe, M. Kunieda, H. Sunohara, Y. Inukai, V.P. Reyes, S. Nishiuchi and K. Doi (2022) A novel combination of genes causing temperature sensitive hybrid weakness in rice. Front. Plant Sci. 13: 908000

  • Kitony, J.K., H. Sunohara, M. Tasaki, J.I. Mori, A. Shimazu, V.P. Reyes, H. Yasui, Y. Yamagata, A. Yoshimura, M. Yamasaki, S. Nishiuchi and K. Doi (2021) Development of an aus-derived nested association mapping (aus-NAM) population in rice. Plants (Basel) 10: 1255.

  • Reyes, V.P., R.B. Angeles-Shim, M.S. Mendioro, M.C.C. Manuel, R.S. Lapis, J. Shim, H. Sunohara, S. Nishiuchi, M. Kikuta, D. Makihara, K.K. Jena, M. Ashikari and K. Doi (2021) Marker-assisted introgression and stacking of major QTLs controlling grain number (Gn1a) and number of primary branching (WFP) to NERICA cultivars. Plants (Basel) 10: 844.

  • Sakata, M., N. Takano-Kai, N, Y. Miyazaki, H. Kanamori, J. Wu, T. Matsumoto, K. Doi, H. Yasui, A. Yoshimura and Y. Yamagata (2021) Domain unknown function DUF1668-containing genes in multiple lineages are responsible for F1 pollen sterility in rice. Front. Plant Sci. 26: 632420.

  • Agata, A., K. Ando, S. Ota, M. Kojima, Y. Takebayashi, S. Takehara, K. Doi, M. Ueguchi-Tanaka, T. Suzuki, H. Sakakibara, M. Matsuoka, M. Ashikari, Y. Inukai, H. Kitano and T. Hobo (2020) Diverse panicle architecture results from various combinations of Prl5/GA20ox4 and Pbl6/APO1 alleles. Comm. Biol. 3: 302.

  • Yamada, S., Y. Kurokawa, K. Nagai, R.B. Angeles-Shim, H. Yasui, N. Furuya, A. Yoshimura, K. Doi, M. Ashikari and H. Sunohara (2020) Evaluation of backcrossed pyramiding lines of the yield-related gene and the bacterial leaf blight resistant genes. J. Intl. Cooper. Agric. Dev. 18: 18-28.

  • Shim, R.B., V.P. Reyes, M.M. del Valle, R.S. Lapis, J. Shim, H. Sunohara, K.K. Jena, M. Ashikari and K. Doi (2019) Marker-assisted introgression of the quantitative resistance gene pi21 confers broad spectrum resistance of rice to blast. Rice Sci. 27: 113-123.

  • Phung H.D., D. Sugiura, H. Sunohara, D. Makihara, M. Kondo, S. Nishiuchi and K. Doi (2019) QTL analysis for carbon assimilate translocation-related traits during maturity in rice (Oryza sativa L.). Breed. Sci. doi: 10.1270/jsbbs.18203

  • Owusu-Nketia, S., Y. Inukai, S. Ohashi, R.R. Suralta, K. Doi, S. Mitsuya, M. Kano-Nakata, J.M. Niones, D.T.N. Nguyen, D.T.N, T. Kabuki, D. Makihara, and A. Yamauchi (2018) Root plasticity under fluctuating soil moisture stress exhibited by backcross inbred line of a rice variety, Nipponbare carrying introgressed segments from KDML105 and detection of the associated QTLs. Plant Prod. Sci. doi: 10.1080/1343943X.2018.1446759

  • Wainaina, C.M., D. Makihara, M. Nakamura, A. Ikeda, T. Suzuki, Y. Mizukami, T. Nonoyama, K. Doi, M. Kikuta, H. Samejima, D.M. Menge, A. Yamauchi, H. Kitano, J.M. Kimani and Y. Inukai (2018) Identification and validation of QTLs for cold tolerance at the booting stage and other agronomic traits in a rice cross of a Japanese tolerant variety, Hananomai, and a NERICA parent, WAB56-104. Plant Prod. Sci. doi: 10.1080/1343943X.2018.1440970

  • Matsukawa, M., M. Tasaki, K. Doi, K. Ito, K. Kawakita and T. Tanaka (2017) Regional population differences of the brown planthopper (Nilaparvata lugens Stål) in Cambodia using genotyping-by-sequencing. Bull. Entomol. Res. doi:10.1017/S0007485317000992

  • Nguyen G.N., Y. Yamagata, Y. Shigematsu, M. Watanabe, Y. Miyazaki, K. Doi, K. Tashiro, S. Kuhara, H. Kanamori, J. Wu, T. Matsumoto, H. Yasui and A. Yoshimura (2017) Duplication and loss of function of genes encoding RNA polymerase III subunit C4 causes hybrid incompatibility in rice. G3 (Bethesda) 7: 2565-2575. doi: 10.1534/g3.117.043943.

  • Watanabe, K., Takahashi, H., Sato, S., Nishiuchi, S., Omori, F., Malik, A.I., Colmer, T.D., Mano, Y., Nakazono, M. (2017) A major locus involved in the formation of the radial oxygen loss barrier in adventitious roots of teosinte Zea nicaraguensis is located on the short-arm of chromosome 3. Plant Cell Environ., 40(2), 304-316.

  • Furuta, T., Ashikari, M., Jena, K.K., Doi, K., Reuscher, S. (2017) Adapting genotyping-by-sequencing for rice F2 populations. G3., 7, 881-893.

  • Win, K.T., Yamagata, Y., Doi, K., Uyama, K., Nagai, Y., Toda, Y., Kani, T., Ashikari, M., Yasui, H., Yoshimura, A. (2017) A single base change explains the independent origin of and selection for the nonshattering gene in African rice domestication. New Phytol, 213, 1925-1935.

  • Gichuhi, E., Himi, E., Takahashi, H., Zhu, S., Doi, K., Tsugane, K., Maekawa, M. (2016) Identification of QTLs for yield-related traits in RILs derived from the cross between pLIA-1 carrying Oryza longistaminata chromosome segments and Norin 18 in rice. Breed. Sci., 66, 720-733.

  • Bessho-Uehara, K., Wang, D.R., Furuta, T. , Minami, A., Nagai, K., Gamuyao, R., Asano, K., Angeles-Shim, R.B., Shimizu, Y., Ayano, M., Komeda, N., Doi, K., Miura, K., Toda, Y., Kinoshita, T., Okuda, S., Higashiyama, T., Nomoto, M., Tada, Y., Shinohara, H., Matsubayashi, Y., Greenberg, A., Wu, J., Yasui, H., Yoshimura, A., Mori, H., McCouch, S.R., Ashikari, M. (2016) Loss of function at RAE2, a previously unidentified EPFL, is required for awnlessness in cultivated Asian rice. Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 113, 8969-8974.

  • Kurokawa, Y., Noda, T., Yamagata, Y., Angeles-Shim, R.B., Sunohara, H., Uehara, K., Furuta, T., Nagai, K., Jena, K.K., Yasui, H., Yoshimura, A., Ashikari, M., Doi, K. (2016) Construction of a versatile SNP array for pyramiding useful genes of rice. Plant Sci., 242, 131-139.

  • Furuta, T., Komeda, N., Asano, K., Uehara, K., Gamuyao, R., Angeles-Shim, R.B., Nagai, K., Doi, K., Wang, D.R., Yasui, H., Yoshimura, A., Wu, J., McCouch, S.R., Ashikari, M. (2015) Convergent loss of awn in two cultivated rice species Oryza sativa and Oryza glaberrima is caused by mutations in different loci. G3., 5(11), 2267-2274.

  • Sakata, M., Yamagata, Y., Doi, K., Yoshimura, A. (2014) Two inked genes on rice chromosome 2 for F1 pollen sterility in a hybrid between Oryza sativa and O. glumaepatula. Breed. Sci., 64, 309-320.

  • Shiono, K., Ando, M., Nishiuchi, S., Takahashi, H., Watanabe, K., Nakamura, M., Matsuo, Y., Yasuno, N., Yamanouchi, U., Fujimoto, M., Takanashi, H., Ranathunge, K., Franke, R., Shitan, N., Nishizawa, N., Takamure, I., Yano, M., Tsutsumi, N., Schreiber, L., Yazaki, K., Nakazono, M. and Kato, K. (2014) RCN1/OsABCG5, an ATP-binding cassette (ABC) transporter, is required for hypodermal suberization of roots in rice (Oryza sativa). Plant J., 80, 40-51.

  • Watanabe, K, Nishiuchi, S, Kulichikhin, K, Nakazono, M. (2013) Does suberin accumulation in plant roots contribute to waterlogging tolerance? Front. Plant Sci., 17(4), 178.

  • Shelley, I.J., Nishiuchi, S., Shibata, K., Inukai, Y. (2013) SLL1, which encodes a member of the stearoyl-acyl carrier protein fatty acid desaturase family, is involved in cell elongation in lateral roots via regulation of fatty acid content in rice. Plant Sci., 207, 12-17.

  • Wada, T., Yasui, H., Inoue, T., Tsubone, Ogata, T., Doi, K., Yoshimura, A. and Matsue, Y. (2013) Validation of QTLs for eating quality of japonica rice ‘Koshihikari’ using backcross inbred lines. Plant Prod. Sci., 16, 131-140.

  • Takano-Kai, N., Jiang, H., Powell, A., McCouch, S., Takamure, I., Furuya, N., Doi, K. and Yoshimura, A. (2013) Multiple and independent origins of short seeded alleles of GS3 in rice. Breed. Sci., 63, 77-85.

  • Win, K.T., Yamagata, Y., Miyazaki, Y., Doi, K., Yasui, H. and Yoshimura, A. (2010) Independent evolution of a new allele of F1 pollen sterility gene S27 encoding mitochondrial ribosomal protein L27 in Oryza nivara. Theor. Appl. Genet., 122, 385-394.

  • Asano, K., Yamasaki, M., Takuno, S., Miura, K., Katagiri, S., Ito, T., Doi, K., Wu, J., Ebana, K., Matsumoto, T., Innan, H., Kitano, H., Ashikari, M., Matsuoka, M. (2011) Artificial selection for a green revolution gene during japonica rice domestication. Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 108, 11034-11039.

 

令和3年度学会発表

  • 天野真宏、長谷川昂平、森拓也、西内俊策、土井一行、松岡信、高橋宏和、中園幹生、村瀬潤異なる水稲栽培品種の根圏微生物群集の施肥に対する応答日本土壌肥料学会2021年度北海道大会

  • 天野真宏、長谷川昂平、森拓也、西内俊策、土井一行、松岡信、高橋宏和、中園幹生、村瀬潤異なる水稲栽培品種の根圏微生物群集の施肥に対する応答日本土壌肥料学会2021年度北海道大会

  • 髙田樹, 中田智大, 西内俊策衛星リモートセンシングを用いた茎立期におけるコムギのNDVI変化の予測日本育種学会 第141回講演会

  • 中田智大, 井上駿, 佐塚隆志, 西内俊策UAVリモートセンシングによる高収量性ソルガムのバイオマス推定技術の開発日本育種学会 第141回講演会

  • 中田智大, 井上駿, 佐塚隆志, 西内俊策UAV 搭載マルチスペクトルカメラを用いた高収量性ソルガムのバイオマス推定技術の開発第28回育種学会中部地区談話会

  • 井上駿, 西内俊策画像解析を用いた小麦穀粒の形質評価手法の開発第28回育種学会中部地区談話会

  • 加藤優介, 西内俊策UAV空撮画像を用いた日本稲の穂数推定手法の開発第28回育種学会中部地区談話会

  • 小林七海, 西内俊策UAVによる圃場キャベツの形質評価手法の検討第28回育種学会中部地区談話会

  • 髙田樹, 西内俊策衛星データを用いた小麦の茎立ち期におけるNDVIの推定第28回育種学会中部地区談話会

  • 加藤優介, 井上駿, 小林七海, 中田智大, 近藤拓也, 西内俊策UAV空撮画像を用いた日本稲の出穂日推定手法の開発日本育種学会 第140回講演会

  • 井上駿, 中田智大, 佐塚隆志, 西内俊策UAV搭載マルチスペクトルカメラを用いた高収量性ソルガムのバイオマス推定技術の開発日本育種学会 第140回講演会

  • 黒木隆一・V.P. Reyes・A.D. Mabreja・西内俊策・土井一行バスマティイネの耐冷性改善のための遺伝解析第 28 回育種学会中部地区談話会

  • 松山恵美子・黒木隆一・西内俊策・土井一行乾燥ストレスに対するイネの根の可塑性の遺伝解析第 28 回育種学会中部地区談話会

  • 黒木隆一・V.P. Reyes・A.D. Mabreja・西内俊策・土井一行バスマティイネの耐冷性改善のための遺伝解析愛知県農学系4機関による研究交流会

  • 黒木 隆一 , V.P. Reyes, A.D. Mabreja, 西内 俊策 , 土 井 一行 バスマティイネの耐冷性改善のための遺伝解析日本育種学会第141回講演会

令和2年度学会発表

  • 縣步美,安藤 考紀,太田自由,小嶋美紀子,竹林 裕美子,竹原 清日,土井 一行,上口(田中)美弥子,鈴木 孝征,榊原均,松岡信,芦苅基行,犬飼義明,北野英己,保浦徳昇イネの多様な穂形態は Prl5/GA20ox4 と Pbl6/ APO1 のアリルの組み合わせによって形成される日本育種学会第138回講演会

  • 保浦徳昇,縣歩美,安藤考紀,太田自由,小嶋美紀子,竹林裕美子,竹原清日,土井一行,上口(田中)美弥子,鈴木孝征,榊原均,松岡信,芦苅基行,犬飼義明,北野英己イネの多様な穂形態の形成に関わる Prl5/GA20ox4とPbl6/APO1で制御される遺伝子群の解析日本育種学会第138回講演会

  • ReyesVP,Angeles-Shim RB,Lapis RS,Shim JH,Sunohara H,Jena KK,Ashikari M,Doi KImprovement of Asian rice cultivars through marker-assisted introgression of yield QTLs Grain Number 1a (Gn1a) and Wealthy Farmer’s Panicle (WFP)

  • 47th Philippine Society for Biochemistry and Molecular Biology Annual Convention

  • Kitony J,Reyes V,Sunohara H,Tasaki M,Nishiuchi S,Doi KNested association mapping using aus-derived population of rice日本育種学会第139回講演会

  • Reyes VP,Shim RB,Sunohara H,Kitony JK,Nishiuchi S,Jena KK,Ashikari M,Doi KDevelopment and evaluation of Gn1a and WFP introgression lines in NERICA genetic background日本育種学会第139回講演会

令和元年度学会発表

  • 加藤優介、西内俊策: UAVと深層学習を用いた圃場水稲の出穂日推定手法の開発。日本育種学会第137回講演会、令和元年3月、東京

  • 小林七海、西内俊策: UAVを用いたハクサイの生育モニタリング技術の開発。日本育種学会第137回講演会、令和元年3月、東京

  • ​井上駿、西内俊策: 水稲籾を用いた黄化籾率推定手法の開発。日本育種学会第137回講演会、令和元年3月、東京

平成28年度学会発表

  • 國枝真依、春原英彦、島津瑛久、田崎三香子、西内俊策、土井一行: 台中65号とaus型イネの交雑後代で見出された染色体1長腕末端領域の分離ゆがみ。日本育種学会第131回講演会、平成29年3月、愛知

  • Danh Huan Phung、春原英彦、西内俊策、安井秀、土井一行: イネ登熟期における転流関連形質のQTL解析。日本育種学会第131回講演会、平成29年3月、愛知

  • Peter Murithi Nthia、春原英彦、田崎三香子、米田典夫、槇原大悟、北野英己、西内俊策、土井一行: ハバタキ由来の収量関連QTLのBasmati370遺伝的背景への導入と評価。日本育種学会第131回講演会、平成29年3月、愛知

  • 春原 英彦、田崎三香子、西内俊策、犬飼義明、土井一行: 穂先の退化を示すイネpanicle tip abortion変異体の解析。日本育種学会第131回講演会、平成29年3月、愛知

  • 近藤拓也、西内俊策: 気象のクラスター解析によるイネの出穂日予測精度向上の試み。日本育種学会第131回講演会、平成29年3月、愛知

  • 塩川貫太、西内俊策: 深層学習プラットホームCaffeを用いたコメの外観品質に基づく分類の試み。日本育種学会第131回講演会、平成29年3月、愛知

  • 西内俊策: 気象とイネの生産性にみられる因果関係の解析。日本育種学会第131回講演会、平成29年3月、愛知

  • Peter Murithi Nthia、春原英彦、田崎三香子、米田典夫、北野英己、土井一行: ハバタキ由来の収量関連QTLのBasmati370遺伝的背景における評価。第24回育種学会中部地区談話会、平成28年11月、三重

  • 國枝真依、春原英彦、島津瑛久、西内俊策、田崎三香子、土井一行: イネ染色体1長腕末端領域の分離ゆがみの遺伝解析。第24回育種学会中部地区談話会、平成28年11月、三重

  • 金平翔太郎、春原英彦、森潤一、島津瑛久、田崎三香子、西内俊策、土井一行: イネNAM集団利用による穂数および稈長QTLのマッピング。第24回育種学会中部地区談話会、平成28年11月、三重

  • 近藤拓也、西内俊策:イネの生育予測に向けた気象分類と予測モデルの作成法。第24回育種学会中部地区談話会、平成28年11月、三重

  • 塩川貫太、西内俊策:画像解析によるコメの外観品質に基づく分類の省力化の試み。第24回育種学会中部地区談話会、平成28年11月、三重

  • 屋宜彩花、西内俊策: UAVを用いた圃場作物の表現型取得。第24回育種学会中部地区談話会、平成28年11月、三重

  • 春原英彦、島津瑛久、森潤一、田崎三香子、西内俊策、土井一行: イネNested Association Mapping集団の作出とGBSによる遺伝子型決定。イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ、平成28年7月、愛知

  • 亀岡笑、北野英己、北栄輔、西内俊策: New challenge of agricultural ICT in Japan: A dynamic e-Crop Calendar for improving rice cultivation efficiency. WCCA AFITA 2016、平成28年6月、韓国

bottom of page